اهداف مرکز تحقیقات بیماری های مادر و جنین (پریناتالوژی) به شرح زیر می باشد:
۱- انجام پژوهش های علمی در زمینه پریناتالوژی و راهکارههای شناخت و درمان، کاهش موربیدتی مادران باردار، کاهش خطاهای پزشکی در حیطه زنان و زایمان، تشخیص و درمان به موقع عوامل تهدید کننده سلامت مادران و ارائه راهکارهای جدید و عملی جهت ارتقاء سلامت جامعه بالاخص مادران باردار
۲- ارائه خدمات پیشگیری، درمانی، بازتوانی، آموزشی و مشاوره ای در مادران باردار، بارداری های پرخطر
۳- ترغیب محققین و دانشجویان در جهت اجرای طرح های تحقیقاتی
۴- هدایت، تسهیل، نظام دار نمودن و اجرای طرح های تحقیقاتی در رشته پریناتالوژی